电影《十三刺客2010》背景设定在江户时代后期，故事开始于明石藩江户之家老间宫图书自杀的事件。这一自杀引起了朝野的震动，一切的根源可以追溯到明石藩主齐昭，他是现任将军的异母弟弟，但性情嗜血，行为暴虐，引起了朝廷上下众多人的不满。然而，齐昭已被内定为下任老中，这使得许多人担心苍生将会遭受他的荼毒。

为了拯救苍生，土井大炊头授意岛田新作卫门刺杀齐昭。新左卫门召集了包括仓永左平太、三桥军次郎、平山九十郎等在内的13名刺客，他们在齐昭必经之地布下了层层埋伏。

这个故事充满了复仇和正义的主题。齐昭的残暴行径引起了众多人的不满，他们希望通过刺杀来终结他的统治，以拯救苍生。电影展现了刺客们的勇气和决心，以及他们对正义的追求。