2009年，一个动物基因组学研究机构的小组在一座庙里研究着魔斯拉，一个来自幼年的生物。然而，这项研究遭到雇佣兵的袭击，魔斯拉逃脱，并在一个瀑布处结茧，然后完成了全身形态的生长。 2014年，哥斯拉的出现改变了世界，人类成立了“帝王组织”来研究怪兽。在水下的基地中，他们研究着哥斯拉以及其他可能存在的生物。然而，尽管曾有短暂的和平时光，怪兽们的觉醒更加威胁人类。这些沉睡于地底和冰川中的神秘巨兽，有着上万年的历史，渴望重新夺回地球。怪兽们的崛起彻底改写了地球的秩序，他们之间的竞争将决定谁是怪兽之王。 帝王组织的力量面临前所未有的挑战，然而，哥斯拉的苏醒为人类带来了一线希望，它开始寻找并消灭可能破坏自然平衡的怪兽。最终，哥斯拉将面对魔斯拉、拉顿和它的宿敌基多拉，这场关键的对决将决定怪兽世界的未来。在这场怪兽之战中，人类也将积极投入，英勇地与哥斯拉并肩作战，誓死保卫地球的未来。
