电影《黑蚂蚁》讲述了林河市公安局局长秘书苏岩参加竞赛类电视节目并与搭档张秋燕获得冠军，然而张秋燕却在当晚被人谋杀。现场发现一只神秘的“黑蚂蚁”，导致苏岩成为了嫌疑人。为洗清嫌疑，苏岩主动加入了刑警队，并结识了死者的表姐孙红。 孙红和报社编辑薛成正在谈恋爱，而薛成恰好也是苏岩在文学方面的笔友兼老师。然而，薛成的姨夫也是孙红的上司，使得这段感情关系变得错综复杂。在警方寻找凶手的过程中，新的命案接连发生，而每次作案后都会带走一张小额存折，并留下一只黑蚂蚁。 随着调查的深入，苏岩发现这些案件似乎都与孙红有关。而且，孙红似乎对案件有所隐瞒。随着剧情的发展，一连串的谜团浮出水面，包括孙红和薛成之间的情感纠葛、薛成家族的复杂关系等等，都使得案情更加扑朔迷离。
