故事发生在一个充满神秘与危险的世界中，主要聚焦在中情局特工维勒（由尚格·云顿饰演）身上。他与美女搭档梅尔正在执行一项危险的任务，保护一份重要的机密文件。然而，他们的任务并不顺利，遭到了神秘组织的追杀。在这场追逐中，梅尔牺牲，而维勒则被捕。 当维勒醒来时，他发现自己被囚禁在一艘核潜艇内，而这艘潜艇位于深海之中，是中情局设在深海的一座黑狱，与外界完全隔绝。更令他感到震惊的是，他被当作国家的叛徒，被指控出卖国家机密。他的处境异常危险。 潜艇内充斥着各种不同身份和动机的人，包括探员帕特里克、维勒的恩师爱德华、女见习生凯茜以及被关押的德国特工马可（由杜夫·龙格尔饰演）。在这个混乱的环境中，维勒必须分辨谁是真正的盟友，谁是潜在的敌人。同时，有人对维勒手中的机密文件表现出浓厚的兴趣，而有人则更关心如何离开这个深海的黑狱，重获自由。
