电影《决战紫禁之巅》带我们踏上了一段明朝刑部大内密探龙龙九的旅程，他被派遣追捕名震武林的“鬼王大盗”。这位犯罪分子手段狠毒，行事神秘莫测，令人防不胜防。为了应对这个威胁，龙龙九联合他的好友、被誉为“剑神”的西门吹雪，踏上了危险的任务。

“鬼王大盗”并不轻易让步，为逃脱追捕，他残忍地杀死了手下四名女侍。然而，在这场决斗中，西门吹雪挽救了其中一位名叫叶子青的女子，并且在救助的过程中，两人的心灵也慢慢互相靠近，陷入了爱河之中。

龙龙九顺利回朝复命，然而，他在刑部却意外遇到了气势逼人的剑圣叶孤城。叶孤城提出了一项惊人的请求，要求龙龙九代他向西门吹雪发起一场决斗，地点定在紫禁之巅的太和殿，以决定谁是世上剑法的第一。这场剑术之争立刻震动了武林，人们纷纷下注，江湖中的赌风熏陶着各界人士。

朝廷为了防止这场决斗引发更大的骚乱，派遣龙龙九和御妹金燕子一同前去制止。金燕子虽然身份显赫，但她对叶孤城心怀崇敬。当叶孤城在京城抵达，与蜀中暗器世家的唐勇展开激烈较量，却在比斗中受伤中毒。金燕子发现叶孤城的英雄气概，毅然决定全力相助，动用宫廷珍贵的雪莲为他治疗伤势。