电影《御前法医大仵作2》以“御前大仵作”宋邵为主角，讲述了他被贬流落至临安县后，再度卷入一系列离奇谜团的故事。这个法医神探的重返仵作行当，充满了悬念和挑战。

在临安县，宋邵过上了一个普通的生活，成为了一位无品无级的师爷。一具女尸死后分娩出男婴以及一具腰斩的男尸的出现，让他被再次卷入了法医仵作的工作。尽管在知府何世琮和县令邹庆之的双重压力下，宋邵陷入了两难之地，但他毫不气馁，坚守正义，化身“法医神探”。

宋邵以验尸为手段，逐渐发现了线索，揭开了一个令人震惊的真相：临江县竟然隐藏着一个恶魔般的杀人凶手，曾经杀害了十六对母子。正当宋邵坚持追求正义，准备将杀人恶魔绳之以法时，更大的阴谋和更多的杀人事件却慢慢浮出水面。