电影《SPEC：零》带观众回溯到2009年，揭开了当麻纱绫和濑文焚流相识前的故事。当麻在美国接受FBI的培训后，回到日本，并被分配到警视厅公安部公安第五课未详事件特别对策系，由组长野野村光太郎亲自领导。与此同时，一系列涉及石油企业高管的谋杀案件发生，每名受害者的心脏上都留下了明显的手印痕迹。这些案件显然与所谓的SPEC持有者有关。

石油企业高管Diablo雇佣了一名神秘的SPEC持有者，名叫一十一，来保护他们免受SPEC持有者的威胁。一十一成为了当麻的顶头上司，但他对当麻持有深刻的怨恨，视她为爆弹女，还斩杀了当麻在美国结识的好友Nancy。