电影《双层公寓》讲述了阿历克斯和南希这对夫妻搬进一座双层公寓的故事。尽管这个公寓有些陈旧，但却是一个美好的居所。然而，唯一的麻烦事是，公寓的二楼住着一个名叫康奈利太太的老人。这位年近一百岁的老人竟然给这对夫妻带来了灾难性的麻烦

康奈利太太总是在不合时宜的时候打扰阿历克斯和南希的生活。她会在阿历克斯专心写作时要求他帮忙做家务，或者在夫妻享受亲密时刻时出现在窗边，用高音量的电视声音打扰他们的睡眠。更糟糕的是，康奈利太太毁了他们的事业，将阿历克斯的书稿毁掉，导致南希失去了工作。

夫妻俩对这个让人受不了的康奈利太太感到忍无可忍，于是决定策划一个神秘的计划，以处理掉这位无法无天的老太太，还有她那只总是充当帮凶的鹦鹉。