曾经的时代，那时有一位被誉为"光之巨人"的英雄，他的职责是保卫世界免受巨型怪物和外星人入侵的威胁。这位英雄就是机动奥特曼，他曾在执行任务时结识了科学考察队员早田进，一同为了和平而战斗，完成使命后又离开了地球。

然而，随着时间的推移，人类进入了一个繁荣的时代，和平的表象下隐藏着危机。世界再次需要"光之巨人"的力量来保护它。正当困境降临之际，一个新的英雄崭露头角，他继承了光之巨人的遗产，成为了新的守护者。这位新英雄的名字叫早田进次郎，他是初代机动奥特曼早田进的儿子。

与他的父亲不同，早田进次郎并没有高大的身材，而是一个中等身材、内心多愁善感的高中生，但他穿着金属动力制服，继承了父亲的衣钵。在克服各种困难和挑战之后，他成为了新一代机动奥特曼，开始了崭新的故事。