电影《最终幻想：灵魂深处》是以备受瞩目的电视游戏《最终幻想》为基础，创作出的一部原创CG动画电影。这部电影于2001年首次上映，标志着电影制作在电脑绘画领域取得了新的里程碑。

故事背景设定在公元2065年，地球已然成为一片充满毁灭和混乱的颓废之地。城市荒芜，人口减少，整个世界被外星生命毁得支离破碎。这些外星敌人以独特的方式袭击地球上的一切生命，只有少数幸存的地球人开始勇敢地反抗。

在这场生死存亡的战斗中，天才女科学家罗丝成为了拯救世界的关键人物。她的计划虽然希望高远，但也伴随着巨大的危险。与此同时，掌握高科技军队的将军也策划了一项打击外星敌人的计划。然而，这个计划同样需要对大自然造成更大的伤害。