电影《无名的功勋》带观众进入了一个充满危机和谜团的间谍世界。故事以国家安全局侦察处处长方健为主角，他深入卧底与大毒枭打成一片，为了追查间谍组织的非法活动，不惜付出一切
然而，方健的妻子郑小敏在长期的寂寞生活中感到孤独，经历了一次胎儿的流产后，她投入了记者高飞的怀抱，爱情的复杂情感纠葛渐次浮现。
故事的复杂性不仅体现在人际关系中，还涉及一项高科技军事技术AS105工程的机密磁盘失窃事件。重大嫌疑人出现，其中包括电视台记者高飞和市委书记的女儿叶华。然而，高飞却突然不幸离世，叶华则深陷爱情的漩涡，与方健之间的关系变得扑朔迷离。
