电影《学校怪谈4》故事发生在海滨小镇戸野崎，恒（由广濑斗史辉饰）与妹妹弥惠（由丰田真唯饰）在新一年的暑假里来到了叔叔的家中度假。然而，他们刚到达的第一天就碰上了一场罕见的大台风。 据当地的亲戚孩子透露，每当台风登陆时，大海中的亡灵将会踏上陆地。虽然这听起来像是无稽之谈，但从那一天开始，小镇上的孩子们陆续目睹到一些奇怪的景象。其中包括在水中玩捉迷藏的鬼魂儿童、通往大海的死亡列车等匪夷所思的情景。更加诡异的是，孩子们相继失踪，这一连串的事件唤起了人们对往事的回忆。 故事的情节回溯到多年前，当时小学建在大海边。一天，几名学生在校舍里玩捉迷藏，然而却遭遇到了前所未有的大海啸，导致孩子们与整个校舍一同沉入海底。如今，这几个逝去的学生似乎仍在寻找继续她们未完成的游戏，将这个小镇陷入了恐怖的漩涡之中。
