电影《摩斯拉》讲述了一群船难幸存者在贝尔岛上被发现的故事。这个岛曾经进行过原子试验,但岛上内部却奇迹般地没有受到辐射的影响。幸存者们相信,他们之所以能够幸免于难,是因为岛上居民给予了他们一种特殊的果汁,起到了保护作用。为了探索这个奇特的岛屿,罗利西亚和日本的科学家进行了一次联合考察。
考察队员们在贝尔岛上发现了许多奇怪的事物,其中包括两个身高仅有一英尺的女人。然而,不道德的考察队队长克拉克·纳尔逊却绑架了这两个女人,并将她们用于杂耍表演。然而,这些女人甜美的歌声中传递出了一种心灵呼唤,向被岛上居民崇拜为神的巨大飞蛾怪兽摩斯拉求救。
摩斯拉听到了女人们的呼唤,并立即响应。巨大的怪兽踏上了前往东京的征途,并在途中带来了毁灭性的破坏。人们为了生存,必须面对这场灾难,并寻找一种方式来平息摩斯拉的愤怒。