故事开始时，时间和空间调查员突然出现在野原家门前，告诉他们时空发生了扭曲。在这个扭曲的时空中，本不应存在的怪兽从怪兽的世界进入了现实世界。这些怪兽只能在现实世界里存在3分钟，然后就会消失。但如果在这3分钟内这些怪兽不被打败，它们将永远留在现实世界中。这一情况对整个世界都构成了巨大威胁。