故事以上海为背景，开始于一个平凡的寺庙，江南名刹龙山寺，这是一个致力于弘扬中华武术的圣地。在这里，许多中小学生课余时间都前来学习武术，包括贺智、白勇和方仁这三位小拳童。尽管他们身材瘦小，但他们拥有让人叹为观止的童子功，引来了众多游客的围观。

一天，一位名叫洪丹尼的美籍华人来到了龙山寺，他以高超的武术表演挑战了大师兄慧觉。这一场意外的挑战让众人目瞪口呆，特别是当洪丹尼用武功徒手削断一块坚硬的石碑时，震惊了中外游客。慧觉感到为难，因为他不愿意打破佛门的规矩。但就在这时，贺智、白勇和方仁三位小拳童挺身而出，代替大师兄接受了洪丹尼的挑战。

洪丹尼的到来引起了一系列连锁反应。导游小姐白彤，在为瘫痪的爷爷进行针灸治疗时，了解到爷爷白浪曾是这一地区的武林高手。白浪对于看到三个小拳童与陌生人的比武感到不安，尤其当洪丹尼对待同胞显得傲慢时，白浪出手教训他，告诉他不要忘了自己的根。

然而，正是这次比武，使洪丹尼和白彤开始了他们的冒险之旅。他们被邀请到香港参加一个儿童武术表演团的计划，旨在向国际社会展示中国武术的精髓。然而，当洪丹尼偶然发现香港巨商姚金山是毒品贩子的真面目时，事情变得复杂起来。

白彤、洪丹尼和三位小拳童必须联手对抗犯罪，揭露姚金山的真正身份，以及阻止他的毒品活动。在这场危机中，他们展现了非凡的智慧和坚韧，最终成功将姚金山绳之以法。电影以正义战胜邪恶的情节，也讲述了洪丹尼和白彤之间爱情的萌芽。