电影《监狱学园 真人版》带观众走进了位于东京郊外的私立八光学园，这个旨在培养高贵大小姐的贵族学校却在2011年4月迎来了一个前所未有的变革，开始了男女合校的新篇章。这一举措让首批迈入校园的五名男生成为了令人瞩目的焦点。

在这个以培养贵族千金为目标的女子学校，一向以清纯高雅而著称，然而这一传统从2011年开始被打破，男生们首次踏足了这片圣地。然而，这五名男生并非外貌出众，可以令众人倾倒，他们在相貌上可谓普通得难以引起关注。在与周围1000名女生一同学习生活的环境下，这些少年能否抑制住自己蓬勃的青春欲望呢？

电影中的主人公藤野清志（由中川大志饰演）与其他伙伴的命运，成为了影片的核心。故事情节发生在八光学园内，这所昔日的女校突然接纳了男生，引发了一系列轰动。面对历史性的转变，藤野清志等五名少年成为了学校历史上的首批男生学员，也因此卷入了一场前所未有的风波。