故事背景设定在20世纪40年代初的动荡岁月，中华民族面临着生死存亡的关键时刻。日寇的侵略肆虐使得国家危机四伏，一些人为了私利背叛国家，投靠敌人，使得抗战形势雪上加霜。在这危急时刻，国民党军统上海站的站长侯坤叛变，导致抗战形势雪上加霜。为了剿灭这些汉奸叛徒，国共两党暗中合作，成立了代号为“十三钗”的秘密行动小组，旨在铲除邹博庵和侯坤等危害抗战大业的敌人。