故事开始于一个光天化日之下的日本东京，一场诡异的交通事故引发了一系列的事件。科学搜查班（ST）的各位成员开始跟踪调查，试图找出这一连串事件的真相。在这个过程中，他们发现了一个名叫镝木彻的天才黑客，似乎是整个事件的幕后操纵者。然而，事情并不像表面看起来那么简单，ST的领导者赤城左门成为了嫌疑人。