未来都市NO.6讲述了紫苑和老鼠之间的冒险生活和两人间的相互羁绊故事的舞台。讲述于2013年的未来都市number6，在这里没有犯罪、没有灾害、没有疾病是充满未来的都市。在都市生活中只要你是由于常人或者属于精英的一类人群，便可以享受着最高的权利和最佳的教育环境与最好的生活。男主角自愿在两岁的时候将人格升级为精英了，但是生活并不是一帆风顺的。在一个瓢泼大雨的晚上，他遇到了另外世界的人，他是老鼠在当时老鼠受到了非常严重的枪伤，从外面的世界来到了紫苑的房屋中，看到当前情形的自愿并没有害怕，反而对老鼠提供了自己的帮助。到了第2天老鼠消失了，自愿也因为窝藏逃犯被剥夺了一系列的权利，被贬低为最下等的市民。紫苑依旧期待着和老鼠重逢，当他们再度重逢时，紫苑却受到了生和死的困难和问题。