幕末动乱时代，德川庆喜将军宣告大政奉还，使得江户幕府面临解体的危机，幕府与讨幕派的对立日益激化。在经历了油小路事件后，新撰组的领导者近藤勇和土方岁三受到了重创，然而他们仍然决定效忠于庆喜。与此同时，皇帝向萨摩藩和长州藩下达了讨幕的密旨，并宣布了王政复古的大号令，正式宣告了德川幕府的终结。庆喜将军因此迁居大阪，新撰组也再次调整身份，从“浪士集团”变为“幕臣”，将屯所迁至伏见奉行所，准备迎接新的战斗。