在《精灵宝可梦：波尔凯尼恩与机巧的玛机雅娜》中，小智和皮卡丘与他们的伙伴继续他们的旅程。一天，神秘的宝可梦波尔凯尼恩突然从天而降，与小智意外地被一条神奇的锁链连接在一起。波尔凯尼恩曾经受到人类的伤害，因此对人类充满了敌意。然而，无论他们如何努力，锁链却让他们无法分开，他们被迫开始了一段奇妙的共同生活。